生物燃料为能源的延续点燃过希望，一度成为世界能源的救星，因为化石燃料的枯竭似乎难以避免，只有可再生能源才能持续满足人类对能源的需求。经过科学界不断的开发研究，生产和应用方面的技术瓶颈已基本突破。然而关于生物燃料的争议随之而来，能源固然稀缺，粮食供应不足也是亟待解决的现实问题。
生产生物燃料的主要原料是玉米、小麦、菜籽等粮食作物，由于该产业的兴起，世界粮食紧缺的问题显得更加严重，不少农民弃食粮种植转而进行燃料作物的耕作，造成世界范围内粮价不断上涨。为了增加收益，燃料作物生产者将生产计划延后，以期待在原料价格上涨后获得更加丰厚的收益。
生物燃燃料产业的兴起大抵依靠政府的各项补助以及税收上的优惠，当其渐成规模后，生产成本才是竞争力所在。生产成本过高本来就是生物燃料难以与化石燃料竞争的原因，原料价格的升高更是令降低成本变成难题。
马来西亚是亚洲地区应用生物燃料最广泛的国家，但是该国考虑在2008年将生物燃料的产量控制在10万吨以下，因为该国用作燃料原料的棕榈油价格增长幅度过大，并且众多棕榈油生产者都有囤积原料以拉高价格的打算。
欧盟和美国也是生物燃料生产大国，受原料价格影响，生物燃料的产量也有所下降。近几个月来，德国已经开始逐步取消对生物燃料的税收鼓励，如此一来，生物燃料的供需皆有所下降，多数生物燃料厂商将产量控制在较低水平。
唯一不同的是巴西，作为生物燃料最大的出口国，巴西非但没有减少生物燃料的意向，反而有进一步扩大的意思，因为该国用于生产生物燃料的甘蔗原料价格走低。由于产量过多，巴西政府考虑在2013年将生物燃料的混合比例提升至5%，而该比例在2008年仅将达到2%。
