加强石化行业与航空业的联合，保障低碳生物燃料供应，是应对欧盟碳税对航空公司经营冲击、保持航空业竞争力的有效手段之一。然而，从目前发展现状看，国内生物航空燃料产业发展面临三大挑战：
一是生产技术有待突破。
例如，通过纤维素生产乙醇及海藻产油等生产技术尚不成熟，地沟油混杂了动物油、植物油等成分，提炼技术难度大。中国石化生物航煤技术虽然取得了重要进展，但大规模应用尚需时日。
二是资金投入大，原料供应渠道不畅。
生物航空燃料的研发和生产建设需要巨大资金投入，国内尚未建立起成熟的生物燃料原料供应体系。
三是价格与成本“瓶颈”长期存在。
由于没有实现规模生产，生物航空燃油价格高于矿物燃油，而购买航油是航空公司最大的成本支出，高昂的价格使得生物航空燃料大范围应用和推广受阻。
欧盟对航空公司征收碳税在增加航空公司运营成本的同时，也向人们传递了加快能源结构转型的信号。欧盟与各国在碳税征收问题上的摩擦只是一个事件、一个窗口，反映的深层次问题是能源结构的转型。
在中国煤炭消费规模和比例居高不下、石油对外依存度日益上升、节能减排任务艰巨的形势下，积极发展包括生物航空燃料在内的生物质能源产业，推进能源供应多元化，既是应对能源短缺的有效途径，又是实现节能减排目标的重要手段。
