四湖流域是江汉平原重要的组成部分，流域水系复杂、河网纵横，人口密集。因特殊的地理环境和城镇环保基础设施建设薄弱，流域内水环境污染形势严峻。为改善四湖流域水环境，探索流域综合治理经验，建设山水林田湖草“生命共同体”。荆州市政府按照“受益者补偿、损害者赔偿、保护者受偿”的原则，建立跨界断面水环境质量生态补偿机制，开展生态补偿试点。
《办法》明确，市政府每年专项列支1000万元，四湖总干渠沿线6个县市区政府(管委会)每年缴纳1000万元，作为四湖流域水质考核和生态补偿奖励专项资金。分别在主渠道和主要支渠设立53个监测考核断面，每月对化学需氧量、氨氮、总磷3项指标进行采测，按照公式计算得分，每季度计算均值，按照各地季度分值所占权重，在年度专项资金的25%范围内计算生态补偿资金。同时规定，水质考核和生态补偿资金必须专款专用，用于四湖流域范围内水污染防治工作，包含考核水系的河道清淤、生态护坡、沿岸截污、生态湿地等项目，且只对地方资金投资的部分进行补助。
通过实施生态补偿试点，调动四湖流域沿线地方政府保护水生态环境的积极性，确保四湖总干渠水质持续改善，到2020年所有国控断面达到国家考核要求。
