自2005年起，各种资金持有者纷纷投入生物柴油这一充满诱惑和风险的“淘金大军”中。大多数投资者简单地认为只要解决了技术问题，生产生物柴油就会“财源茂盛”！但是技术问题的解决仅仅是入行的基础，之后还将面临诸多复杂的问题，更需要投资者理性对待与思考。
1.资金生物柴油项目的产业性质为产量大、利润小，没有一定的生产规模难以形成效益，而规模的形成则需要资金支持。一般而言，5000t/a规模生物柴油项目需要固定资产和流动资金约300万元，这还不包括征地所需资金等非生产性固定资产投资。目前很多企业都面临开工后流动资金不足的困难，导致生物柴油装置难以正常运行。
2.技术理论上生物柴油的技术和工艺已经成熟，但目前存在的问题主要是如何降低原有工艺的生产成本，同时还要能识破市场上五花八门的假技术。专业技术人员的缺乏，也是发展生物柴油的一大瓶颈。
3.场地大多数投资者钟情于租赁场地，这对于企业的长远发展极为不利。建议投资者在资金充足的情况下，首先选择工业用地，办理好必要的手续（尤其是环境评价和安全评价），之后再投资设备进行生产。
4.原料原料供应不足、价格上涨、质量参差不齐等是目前困扰生物柴油行业的普遍问题，因此在上项目之前一定要把周边一定范围内的原料情况调查清楚，以保证生产。目前生物柴油原料价格上涨主要是由于废弃油脂用作饲料油和油脂化工原料造成的，建议企业要注意避免一条腿走路，可在产品销售初期采用生物柴油、脂肪酸甲酯并行销售的办法。
目前市场上最紧俏的是大豆酸化油，它是油脂化工企业的首选原料。由于脂肪酸市场价格一路走高，带动大豆酸化油价格上涨至3500～3600元/t，采用酸化油生产生物柴油没有利润，因此企业要避免使用大豆酸化油；虽然地沟油价格也在上涨，但用于生产生物柴油还有微利。
5.设备国内市场有两种设备供应形式：①采用几家公司的成套设备；②按技术方提供的清单自行采购安装。第二种形式更适用于国内企业，此外企业还应注意生产设备（尤其是核心设备）应尽量采用标准设备，比如用于酸性反应的酯化釜最好选用标准搪瓷反应釜。
6.市场生物柴油虽然不愁销售，但其销售过程也不可能一帆风顺，建议投资者在项目调研期间做好市场调查，可先以实验室样品与用户进行初步的交流，基本确定产品定位（价格和数量），以确保销售渠道畅通。
