一项雄心勃勃的计划启动了,该计划将在未来十年对所有已知的裸藻(euglenoid algae)类物种进行基因组测序。
该计划背后的科学家联盟相信,它有可能推动从新型生物燃料、可持续食品到抗癌药物等领域的突破。
裸藻(Euglena)国际联盟(EIN)成立于2020年,是一个由世界各地数百名科学家组成的全球联盟,其共同目标是通过学术界和工业界之间的协作和整合组学来支持裸藻科学。
裸藻国际联盟刚刚在《生物学公开》(Biology Open)上发表了一篇论文,概述了为近1000种已知的裸藻类物种生成高质量参考基因组的一致努力。
裸藻类物种具有转化应用,在生物燃料、营养药品、生物修复、癌症治疗,甚至作为机器人设计模拟器的生产方面显示出巨大的前景。由于缺乏高质量的参考基因组,它们的巨大潜力在很大程度上尚未得到开发。
裸藻类物种是原生生物的一部分,是不属于动物、植物或真菌类群的真核生物的家园。这些多样化的单细胞生物在世界各地异常广泛的生态系统中被发现。
裸藻类基因组呈现了一个特殊的测序挑战,因为它们是次生内共生的一个例子——容纳线粒体、叶绿体和它们所包裹的生物体的遗传物质残留物,以获得这些细胞器。
因此,通过基因组学在任何水平上探索转译潜力的物种不到20个。裸藻国际联盟认为是时候解决这个问题了。
通过为已知的裸藻类物种生成高质量的参考基因组,裸藻国际联盟将致力于:
了解裸藻的基本生物学。
了解裸藻的进化。
在生态和环境管理中最大限度地利用裸藻。
并探索、翻译和商业化裸藻产品。
裸藻国际联盟收集的数据将通过欧洲核苷酸档案公开提供给科学界。一旦进入欧洲核苷酸档案,注释的基因组可以导入到诸如ensemble prosts等资源中,并以统一和公平的方式呈现给研究群体。